АВТОРЕФЕРАТ
Было проведено исследование с использованием набора из четырех кандидатов в генные маркеры для накопления цинка в зерне, а генетический полиморфизм был изучен на двенадцати генотипах риса. Цель состояла в том, чтобы изучить природу генетической изменчивости на молекулярном уровне для характеристики этого генотипа. Направленная амплификация направленного праймера-кандидата на основе гена была успешно достигнута всеми парами праймеров. Полиморфизм был признан среди генотипов в виде отсутствия полос. Анализ паттерна полиморфизма, основанный на профилях амплификации, ясно показал, что вариации нуклеотидных последовательностей в сайтах связывания праймеров в предполагаемых генах-кандидатах были наиболее вероятным случайным фактором для дифференциальных генотипов риса с накоплением цинка в зернах. Обнаружение неаллелей в некоторых генотипах, основанное на анализе амплификации на основе кандидатных генов, в основном послужило основой для установления связи между нуклеотидными вариациями в сайтах связывания праймеров и дифференциальным накоплением цинка в зернах в генотипе риса.
Введение
Рис – это зерновое зерно из вида травы (Oryza sativa L.) семейства Poaceae. Он обеспечивает 20 процентов энергии на душу населения, а его белковый вклад составляет 13 процентов. Это основная пища для одной трети населения мира с потреблением на душу населения от 62 до 190 кг / год. Это основной источник дохода для мелких фермеров. Он обрабатывается более чем на 150 гектарах земли, в основном методом затопления, чтобы избежать заражения сорняками и вредителями.
Согласно анализу данных, проведенному в 2014 году, Китай является крупнейшим производителем риса во всем мире с производством 206,5 млн. тонн, в то время как Индия занимает второе место по производству риса с производительностью 157,2 млн. тонн, и когда мы говорим о Бихар, он приносит около 6356,7 тонн. В развивающихся странах производство риса составляет 95 процентов, а производство риса в мире в целом составляет 741,5 миллиона тонн, что является источником жизни более половины населения. Если мы проанализируем данные 2016 года, то в мире будет произведено 446,0 миллиона тонн и Индия в тот же момент приносит около 104 производства, а Индия в тот же момент приносит около 104,32 млн. Тонн.
Рис имеет высокое содержание минеральных веществ и питательных веществ, что важно для роста и развития растений. Если мы приходим к цинку, рисовые отруби содержат 50,3 ч / млн в концентрации цинка по сравнению с 8,6 ч / млн в эндосперме. Цинк действует как кофактор более чем 300 ферментов. Он также играет важную роль в транспирации, репликации ДНК, синтезе белка и т. д. Он помогает растению вырабатывать хлорофилл. Генами, содержащими концентрацию Zn в рисе, являются OsNAS3, OsNAS1, OsNAAT1, OsYSL, MTP1 и др. Причины его дефицита многие расстройства у растений, такие как хлороз, при котором происходит обесцвечивание листьев, а у риса это приводит к появлению пыльных коричневых пятен на верхних листьях чахлых растений, повышению стерильности колоска у риса, уменьшению размера листовых пластин и появлению белых линий вдоль средней жилки листа, вызывая заболевания например, пневмония, желтуха, поражение мозга и т. д. Около 71 процента населения страдают от дефицита цинка, что составляет около 2 миллиардов человек во всем мире из-за уменьшения концентрация цинка в посевах риса.
Для борьбы с дефицитом Zn предпринимаются некоторые меры, такие как селекция культур, дающих высокий урожай и накапливающих минералы, отбор зародышевой плазмы с большим количеством Zn и т. д. Но наиболее эффективным средством является биообогащение, при котором содержание биодоступных питательных веществ в растении увеличивается. .
Настоящее исследование было проведено с целью изучения паттерна полиморфизма и характера дифференциации и дивергенции в отношении дифференциального накопления цинка в зерне среди сортов риса с использованием праймеров-кандидатов на основе генов.
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Мюррей и соавт. (1980) представили метод быстрого выделения высокомолекулярной растительной ДНК (50000 пар оснований или более в длину), которая не содержала загрязняющих веществ, которые мешают полному перевариванию эндонуклеусами рестрикции.
Meyerhans et al. (1990) провели ПЦР-коамплификацию двух отдельных последовательностей гена tat ВИЧ1, которые привели к образованию молекул рекомбинантной ДНК. Частота таких рекомбинантов, до 54% всех амплифицированных молекул, может быть уменьшена в 2,7 раза за счет 6-кратного увеличения времени удлинения Taq ДНК-полимеразы.
Чакраварти и соавт. (2006) заявили, что все праймеры показали различный полиморфизм среди исследованных сортов, что указывает на устойчивую природу микросателлитов в выявлении полиморфизма.
Padmalatha et al. (2006) представили оптимизацию выделения ДНК и условий ПЦР для анализа RAPD выбранного лекарственного и ароматического растения. Содержание ДНК составляло 1-2 мкг / мкл на грамм ткани листа, а чистота составляла 1,6-1,7, что указывает на минимальный уровень загрязняющих метаболитов.
Нараянан и др. (2007) проанализировали экспрессию генов, связанных с металлом, в листьях флагов и без флагов четырех разных сортов риса в период средней загрузки зерна. Гены (24 из 36) демонстрировали низкие не обнаруживаемые сигналы на микрочипе, в то время как было обнаружено, что 12 генов имеют высокую экспрессию как на флаговых, так и на нелегальных листьях всех 4 сортов.
Carrigg Cora et al. (2007), выполнив анализ профилей DGGE, полученных с помощью полимеразной цепной реакции очищенных экстрактов ДНК, продемонстрировал, что выбор метода выделения ДНК значительно повлиял на генерируемое бактериальное сообщество.
Чжан и соавт. (2008) утверждали, что в следах горшков оптимальное внесение только N в культуру риса может увеличить концентрацию Fe в полированном рисе.
Garcia-Oliveria et al. (2009) выявили в общей сложности 31 предполагаемый локус количественных признаков (QTL) для Fe, Zn, Mn, Cu, Ca, Mg, P и K с помощью одноточечного анализа. Дикий рис (O.ruflpogon) обеспечил благоприятные аллели для большинства QTL (26 QTL), а хромосомы 1,9 и 12 показали 14 QTL (45%) для этих признаков, в то время как наибольшее количество фенотипических изменений (11% – 19%) ) наблюдался возле маркера SSR RM152 на хромосоме 8.
Арнольд и соавт. (2010) показали с помощью математической модели, что для реалистичных скоростей секреции фитозидерофор-деоксимугиновой кислоты (DMA) рисом и влияния DMA в почве, солюбилизации и поглощения по надлежащему механизму необходимо и достаточно для учета измеренного Zn поглощение и разница между генотипами.
Ушарани и соавт. (2012) идентифицировали три полиморфных маркера SC 120, SC 128 и SC 129, которые не были связаны, и, следовательно, был проведен анализ одного маркера, чтобы проверить связь маркера с признаком. SC129 показал наибольшие значительные различия как с железом, так и с цинком в диапазоне R2 = 13,09% и R2 = 19,51% соответственно.
Sperotio et al. (2013) утверждают, что листья флага играют важную роль в синтезе и перемещении фотоассимилятов в семена риса, влияя на урожай зерна.
Impa et al. (2013) заявили, что был разработан протокол для выращивания в агерном питательном растворе (ANS) с оптимальным Zn-достаточным ростом, достигнутым при 1,5 мкГн ZnSo4,7H2O. Окислительно-восстановительный потенциал в ANS показал снижение с + 350 мВ до -200 мВ, имитируя уменьшенное состояние затопленных рисовых почв.
Brar et al. (2014) изучали генетическое разнообразие четырнадцати генотипов, используя 50 микросателлитных маркеров, равномерно распределенных по геному риса. Всего было обнаружено 257 аллелей, которые варьировались от 1 до 9, в среднем по 5,14 аллелей на локус. Общий размер продуктов амплифицированной ПЦР варьировался от 73 до 585 п.н. Значение содержания полиморфной информации (PIC) варьировалось от 0 до 0,862 при среднем значении 0,66.
Wang et al. (2014) заявили, что по сравнению с CF режим AWD значительно увеличил урожай зерна и концентрацию Zn как в коричневом, так и в полированном рисе. Урожай зерна генотипа (Nipponbare и Jiaxing27) в среднем увеличился на 11,4%, а концентрация цинка в зерне – на 3,9% по сравнению с режимами CF.
Wang et al. (2014) отметили, что энтофитные штаммы успешно заселяют корни риса через 72 часа. Улучшение морфологии корней и роста растений риса наблюдалось после инокуляции штаммами, особенно SaMR 12 и SaCS20.
Suma et al. (2015) заявили, что из 50 исследованных пар праймеров SSR и CGs 47 показали полиморфизм при скрининге у 12 генотипов риса. Тенденция разнообразия была оценена на основе количества аллелей, индекса генетического разнообразия Nei и содержания информации полиморфизма (PIC).
Миа и соавт. (2015) отметили, что три маркера (Rm23, RM35 и RM217) показали эффективный полиморфизм в появлении полосы ДНК для содержания Zn из 10 маркеров SSR.
Джонсон-Бибут и др. (2016) утверждают, что поведение Zn в генотипе риса определяет судьбу Zn от почвы к зерну. Это имеет значение для преодоления барьеров транслокации Zn между вегетативными частями и зернами и достижения цели биообогащения цинка в зерне (30,0 мкг /).
Мори и соавт. (2016) отметили, что толерантные генотипы продуцировали больше коронных крон на растение и имели более высокие показатели поглощения на единицу площади поверхности корня; последний был по меньшей мере так же важен, как корень, для общей толерантности.
Affholder et al. (2017) заявили, что различия в вентиляции почвенного CO2 через корневую аэренхиму были ответственны за эффекты генотипа и плотности посадки.
Если взглянуть на школы в Ричмонде, штат Калифорния, и сравнить их со школами в Конкорде, штат Калифорния, можно увидеть огромную разницу. Мало того, что жилой
Преподавание существительных в важной области интересов в преподавании английского языка, которая всегда привлекала мое внимание и внимание моих учеников. Это обширная область, которая может связать
В графическом романе Элисон Бешдель «Веселый дом» она рассказывает о своей семье, но больше о своих отношениях с отцом. Она изображает своего отца эмоционально разъединенным