Сочинение на тему Обзор метода RAPD для выявления генетической вариации
- Опубликовано: 19.05.2020
- Предмет: Наука
- Темы: Ген, генетика, Генная инженерия
Введение
Достижения в области методов атомной науки позволили выявить неограниченные количества ДНК-маркеров для всех целей и задач. Полезность маркеров на основе ДНК в основном продиктована инновацией, которая используется для выявления полиморфизма на основе ДНК. Прямо сейчас, исследование полиморфизма длины части конфайнмента было решением для некоторых видов, чтобы оценить наследственное приличное разнообразие и построить наследственную связь. Как бы то ни было, тест RFLP, который распознает полиморфизм ДНК посредством обработки соединений с ограничением, в сочетании с гибридизацией ДНК, в общем, утомителен и труден. В течение последнего десятилетия инновация в отношении полимеразной цепной реакции превратилась в безграничную процедуру исследования и подтолкнула к улучшению нескольких новых наследственных тестов в свете особой интенсификации ДНК.
Открытие того факта, что ПЦР с произвольной основой может использоваться для увеличения расположения произвольно переданных локусов в любом геноме, способствовало улучшению наследственных маркеров для целого ряда целей. Простота и уместность системы RAPD очаровали преимущества многочисленных исследователей. Возможно, фундаментальным объяснением достижения результатов исследования RAPD является получение большого числа наследственных маркеров, которые требуют небольших измерений ДНК без предварительных условий для клонирования, секвенирования или некоторого другого типа атомной характеристики генома вида, к которому относится , В наши дни устоявшаяся микробиологическая диагностика в свете фенотипических признаков новообразований не полностью реагирует на расширение предпосылок эпидемиологического обследования. Небольшое обследование обычно не дает однозначных результатов; паразитарная культура и биохимические тесты пожирают массу времени и часто взятые вместе, не подходят для эпидемиологического обследования.
Симптоматические проблемы в различении доказательств роста на уровне типов животных эффективно расширяют возможности дальнейшего развития процедур. Среди них субатомные стратегии имеют невероятное значение, что делает возможным создание усовершенствованного, быстрого и надежного отличительного расположения микроорганизмов. Ранее упомянутая атомная экспертиза расширяет возможности между видами и, кроме того, внутривидовое разделение происходит из-за приличного разнообразия артикуляции аллельного качества или из-за контрастов нуклеотидов. Болезнь делает потребность в умеренно базовом и экономичном инструменте для составления дрожжей в клинических эпидемиологических исследованиях значительно более существенной. Существуют стратегии, описанные как профилирование множественных произвольных ампликонов, которые зависят от использования основ субъективных олигонуклеотидов для усиления ДНК. Следует в первую очередь рассмотреть вопрос о непоколебимом качестве связанной процедуры составления, включая существенные части точности метода испытаний – его повторяемость, воспроизводимость и предвзятость. Эти параметры должны быть установлены в течение времени, затрачиваемого на усовершенствование системы разведки, чтобы получать только воспроизводимую и надежную информацию.
Описание метода RAPD, включая оценку RAPD
Стандартное новшество RAPD (Williams et al., 1990) использует короткие изготовленные олигонуклеотиды (10 оснований в длину) нерегулярного расположения в качестве основы для открытия нанограммовых измерений агрегационной геномной ДНК при низких температурах усиления с помощью ПЦР. Элементы для интенсификации в основном изолированы на агарозных гелях и окрашены бромидом этидия. Предварительные сведения о декамерах доступны в финансовом отношении из разных источников (например, Operon Technologies Inc., Аламеда, Калифорния). Welsh и McClelland (1990) автономно создали сопоставимую процедуру, используя введение около 15 нуклеотидов в длину и разнообразные условия усиления и электрофоретики из RAPD, и считали ее системой самоутвержденной праймерной полимеразной цепной реакции (AP-PCR). ПЦР-интенсификация с введением короче 10 нуклеотидов. ДНК-фингерпринтинг (DAF) также использовался для создания ошеломляющих профилей дактилоскопии ДНК (Caetano-Annoles et al., 1991). Хотя эти методологии разнообразны в отношении длины произвольной основы, условий улучшения и стратегий восприятия, все они отличаются от стандартного условия ПЦР (Erlich, 1989) тем, что используется только одиночный олигонуклеотид нерегулярной последовательности и не требуется более раннее изучение геном подлежит исследованию не требуется. При надлежащей температуре ужесточения в теплом цикле олигонуклеотидные основы нерегулярного расположения связывают несколько готовящихся направлений целочисленных последовательностей в геномной ДНК макета и создают отдельные элементы ДНК, если эти готовящиеся локали находятся внутри амплифицируемого разделения друг друга.
Профиль усиленной ДНК, по существу, основан на гомологии нуклеотидной группировки между форматной ДНК и олигонуклеотидом, предварительно к концу каждого увеличенного элемента.
Преимущества метода RAPD
Основные интересы инновации RAPD включают в себя (I) разумность для работы над таинственными геномами, (ii) уместность в вопросах, где доступны только ограниченные количества ДНК, (iii) профессионализм и низкая стоимость.
Большое количество деталей имеют форму. Это простая стратегия. Дискреционные основы, используемые для этого метода, могут быть легко получены, и нет необходимости в вводных наследственных или геномных данных, а удельная стоимость за единицу измерения является низкой. RAPD имеют выгодную позицию, что они могут быть приобретены за разумную цену и, в целом, откроют область действия большей части ДНК и обнаружат полиморфизмы. Определенные наработки дадут нерелевантные примеры между случайными и неразличимыми для тесно связанных существ. Вероятно, базовые локации хаотично распространяются по целевому геному и флангу как в сохраненных, так и в исключительно факторных районах. Может показаться, что между испытаниями можно воспроизвести большое разнообразие в силовом диапазоне, что может быть следствием различных дубликатов открытых областей в формате или эффективности, с которой увеличиваются конкретные районы. Полиморфные группы, полученные из RAPD, также могут быть клонированы для дальнейшего изучения.
НЕДОСТАТКИ RAPD Маркеры RAPD огромны. Интенсификация происходит либо в локусе, либо нет, что приводит к подсчету баллов ввиду близости или отсутствия присутствия. Это подразумевает, что гомозиготы и гетерозиготы не могут быть распознаны. Более того, неявление группы из-за отсутствия объективной договоренности не может быть распознано по тому, что происходит из-за отсутствия усиления по разным причинам (например, низкое качество ДНК), добавляя двусмысленности в понимании результатов. Ничего не думают о личности предметов интенсификации, кроме случаев, когда экзамены подтверждаются семейным расследованием. Проблемы с воспроизводимостью возникают в результате того, что RAPD испытывает уязвимость к изменениям природы ДНК, частей ПЦР и условий ПЦР, приводя к изменениям улучшенных частей. Воспроизводимые результаты могут быть получены, если принять меры для институционализации используемых условий (Munthali et al., 1992; Lowe et al., 1996).
Проблемы совместного движения поднимают такие вопросы, как «Сравнение квадрата с размерными группами с разрезом ДНК»? Близость полосы неразличимого субатомного веса у разных людей не подтверждает, что люди разделяют эквивалентную (гомологичную) часть ДНК. Группа, выделенная на геле как отдельная, может включать в себя различные элементы усиления. Это связано с тем, какой тип гель-электрофореза используется, хотя он готов к количественному выделению ДНК (то есть, как указано размером), не может субъективно разделять эквивалентные оцененные срезы (то есть, как указано в базовой схеме).
Использование редактирования и изменения генома для разработки и конструирования атрибутов будущих детей было поддержано и одобрено Советом по биоэтике Наффилда; В докладе говорится, что морально
РНК-интерференция (RNAi) – один из самых захватывающих и революционных новых подходов к терапии, который привлек значительное внимание в течение последних нескольких десятилетий. Было обнаружено, что
В современном мире влияние, которое наука может оказать на жизнь, как мы знаем, остается очень важным. Много исследований проводится в отношении риска вирусных инфекций среди