Что такое геномная библиотека и как она работает? сочинение пример

ООО "Сочинения-Про"

Ежедневно 8:00–20:00

Санкт-Петербург

Ленинский проспект, 140Ж

magbo system

Сочинение на тему Что такое геномная библиотека и как она работает?

Геномная библиотека – это совокупность совокупной геномной ДНК из одного организма. ДНК хранится в множестве идентичных векторов, каждый из которых содержит разные вставки ДНК. Принимая во внимание конечную цель создания геномной библиотеки, ДНК существа извлекается из клеток и затем обрабатывается рестриктазой, чтобы разрезать ДНК на кусочки определенного размера. Затем части встраивают в вектор с использованием ДНК-лигазы. Затем векторная ДНК может быть поглощена живым существом-хозяином – как правило, популяцией Escherichia coli или дрожжей – каждой клеткой, содержащей только один атом вектора. Использование клетки-хозяина для передачи вектора учитывает легкую амплификацию и извлечение определенных клонов из библиотеки для исследования.

Существует несколько видов векторов, доступных с различными пределами встраивания. По большей части библиотеки, созданные с использованием существ с большими геномами, нуждаются в векторах, выделяющих большие добавки, таким образом, ожидается, что в библиотеку попадет меньше векторных частиц. Ученые могут выбрать вектор, дополнительно учитывая идеальный размер для встраивания, чтобы найти желаемое количество клонов, необходимых для полного охвата генома.

Геномные библиотеки регулярно используются для секвенирования приложений. Они приняли существенное участие во всей последовательности генома нескольких форм жизни, включая геном человека и несколько модельных форм жизни.

Первичный полностью основанный на ДНК геном был осуществлен двукратным лауреатом Нобелевской премии Фредериком Сангером в 1977 году. Сэнгер и его группа исследователей создали библиотеку бактериофага phi X 174 для использования в секвенировании ДНК , Значимость этого достижения добавила к постоянно растущему интересу к секвенированию геномов для исследования генной терапии. В настоящее время группы готовы каталогизировать полиморфизмы в геномах и изучить те качества заявителя, которые усиливают такие заболевания, как болезнь Паркинсона, болезнь Альцгеймера, рассеянный склероз, ревматоидная боль в суставах и диабет 1 типа. Это связано с прогрессом всех инклюзивных исследований принадлежности к геномным библиотекам и их преемственности. Ранее, исследования по связям и качеству заявителя были частью основных методологий.

Разработка геномной библиотеки

Разработка геномной библиотеки включает создание множества рекомбинантных молекул ДНК. Геномная ДНК существа отделяется и после этого обрабатывается рестрикционным химическим веществом. Для существ с небольшими геномами (~ 10 кб) обработанные части могут быть выделены гель-электрофорезом. Затем выделенные срезы можно было бы независимо извлекать и клонировать в вектор. Несмотря на то, что экспансивный геном обрабатывается с ограничением белка, есть очень много частей, которые можно извлечь независимо. Целое расположение фрагментов должно быть клонировано вместе с вектором, и после этого может произойти разбиение клонов. В любом случае кусочки лигируют в вектор, который был обработан аналогичным ограничивающим соединением. Вектор, содержащий встроенные части геномной ДНК, можно будет затем привести в жизненную форму хозяина.

Стадия 1: выделение ДНК:

Отделить готовую ДНК от фага (или другой исследуемой клетки)

Стадия 2. Разрезание сегрегированной ДНК с помощью ограниченных участков разумного размера:

Ограничивающие белки, такие как Eco R1, используются для разрезания генома на участки соответствующего размера.

Стадия 3: в сотрудничестве эта часть в разумный вектор:

Эти фрагменты клонируются в соответствующий вектор, такой как плазмида, космида и т. д., что способствует развитию атома рДНК.

Стадия 4. Знакомство с соответствующим хозяином, таким как бактерия:

Умножение, скрининг, идентификация и изображение клонов

Регулярно представляйте этот атом рДНК с частью ДНК в бактерии-хозяине E.coli. Плазмида будет продублироваться внутри, формируя различные копии. Нам нужно распознать клетки с этими срезами от того, что осталось от клеток без частицы рДНК.

Этап 5: поддержка набора клонов:

Клетка-хозяин дублирует и создает колонии. Каждое государство содержит клетки с ДНК частью фага. Содержание таких провинций, содержащих все кусочки фага, говорит о геномной библиотеке фага.

<Р> Приложения

После создания библиотеки геном формы жизни можно упорядочить, чтобы проиллюстрировать, как качества влияют на живое существо, или подумать о сравнительных существах на уровне генома. Экспансивные исследования принадлежности могут признать качества заявителя, происходящие из многочисленных практических характеристик. Качества могут быть ограничены с помощью геномных библиотек и использованы на линиях клеток человека или моделях существ для продвижения исследований. Кроме того, создание клонов с высокой константностью с точным изображением генома и отсутствием проблем с твердостью – также послужило бы промежуточным звеном для секвенирования дробовика или для исследования качеств отделки в полезном исследовании.

Прогрессивная последовательность

Одно заслуживающее внимания использование геномных библиотек – иерархическое секвенирование дробовика, которое также называется секвенированием сверху вниз, контуром или клонированием за клоном. Эта методология была разработана в 1980-х годах для секвенирования целых геномов, ранее были доступны высокопроизводительные системы для секвенирования. Отдельные клоны из геномных библиотек можно разделить на более мелкие части, обычно от 500 до 1000 п.н., которые более целесообразны для секвенирования. Как только клон из геномной библиотеки секвенирован, можно использовать эту систему для скрининга библиотеки на предмет различных клонов, содержащих встраивания, которые покрывают секвенированным клоном. Любые новые клоны покрытия затем могут быть секвенированы в обрамлении контига. Эту процедуру, называемую прогулкой по хромосомам, можно использовать для организации целых хромосом.

Секвенирование всего генома – это еще одна стратегия для секвенирования генома, для которой не требуется библиотека векторов с высоким пределом. Или, может быть, он использует вычисления на ПК, чтобы накопить кратковременные обращения, чтобы охватить весь геном. Геномные библиотеки часто используются как часть смеси с секвенированием всего генома дробовика, таким образом. Руководство высокой четкости может быть сделано путем секвенирования двух отделов добавок из нескольких клонов в геномной библиотеке. В этом руководстве приводятся схемы разделения известных разделений, которые могут быть использованы для облегчения сбора информации о группировке, приобретенной с помощью последовательности дробовика. Последовательность генома человека, которая была объявлена ​​законченной в 2003 году, была собрана с использованием как библиотеки BAC, так и секвенирования дробовика.

Дальнейшая принадлежность к размышлениям о

Обширные исследования принадлежности – это общие приложения для выявления конкретных качественных целей и полиморфизмов внутри человечества. По правде говоря, международное предприятие HapMap было создано через организацию исследователей и офисов из нескольких стран для инвентаризации и использования этих данных. Целью этой задачи является противопоставление наследственных группировок разных людей с уточнением сходств и контрастов внутри хромосомных областей. Ученые из большей части стран, представляющих интерес, перечисляют эти свойства с информацией от населения африканского, азиатского и европейского происхождения. Такие обширные оценки могут спровоцировать дальнейшее демонстративное и медикаментозное лечение, а также помочь будущим группам сосредоточиться вокруг организации терапии в свете наследственных особенностей. Эти идеи в настоящее время используются в генной инженерии. Например, исследовательская группа действительно создала вектор переноса PAC, который делает библиотеку говорящей с двумя перекрывающимися областями человеческого генома. Это может стать невообразимым активом для распознавания качеств или наборов качеств, вызывающих болезнь. Кроме того, эти исследования могут быть использованы в качестве интенсивного метода для исследования направления транскрипции, как это было обнаружено при исследовании бакуловирусов. В целом, прогресс в развитии библиотеки генома и секвенирования ДНК рассматривал эффективное выявление различных атомных целей. Усвоение этих основных моментов с помощью таких продуктивных методов может ускорить работу новых потенциальных лекарств. ВОПРОС № 2: Запишите различия между бактериальными искусственными хромосомами (BACs) и дрожжевыми искусственными хромосомами (YACs)?

БАКы YACs

YAC – это наследственно разработанная хромосома с использованием дрожжевой ДНК с конечной целью клонирования. BAC – это наследственно построенная ДНК-частица, использующая ДНК E. coli для клонирования.

Половые YAC были предназначены для клонирования огромных кусков геномной ДНК в дрожжи. ВАС были получены для клонирования обширных геномных частей в Escherichia coli.

YAC длины вставки могут содержать геномные вставки размером с мегабазу (1000 кб – 2000 кб). BAC могут передавать дополнения размером 200–300 кб или меньше.

Разработка ДНК YAC трудно чистить безупречно и требует высокой фиксации для создания векторной системы YAC. BAC совсем не сложно улучшить, и его можно легко создать. Химеризм ЯКы регулярно химерны. ВАС редко бывают иллюзорными. Уравновешенность ЯК нестабильна. BAC устойчив.

Настройки. Дрожжевая рекомбинация чрезвычайно возможна и надежно остается динамичной. Отныне он может создавать стирания и различные ревизии в YAC. Ожидается рекомбинация кишечной палочки, которая включается при необходимости. Отныне это уменьшает нежелательные пересмотры в BAC.

Поддержка. Для управления рекомбинантными YAC обычно требуется, чтобы YAC был перемещен в E.coli для последующего контроля. Таким образом, это сложный процесс. Регулировка BAC происходит именно в E.coli. Так что нет необходимости в обмене ДНК. Отныне процедура не является трудной. Количество копий. Один вектор YAC встречается на дрожжевую клетку. 1-2 BAC вектора встречаются на бактериальную клетку. Выбираемый маркер Бактериальный селектируемый маркерный ген. Для отбора трансформантов; может быть геном устойчивости к антибиотику или LacZ.

Вектор YAC представляет собой фальшивый векторный каркас с высоким пределом клонирования (до 1000 кб), в то время как вектор BAC является поддельным векторным каркасом с низким пределом клонирования (до 200 кб) при сравнении с YAC. Векторы YAC превращаются в дрожжевые клетки, а векторы BAC превращаются в микроскопические организмы. Принципиальным контрастом между векторами YAC и BAC является их предел клонирования и хозяина.

Зарегистрируйся, чтобы продолжить изучение работы

    Поделиться сочинением
    Ещё сочинения
    Нет времени делать работу? Закажите!

    Отправляя форму, вы соглашаетесь с политикой конфиденциальности и обработкой ваших персональных данных.